Détail du poste Établissement : Université de Montpellier École doctorale : GAIA - Biodiversité, Agriculture, Alimentation, Environnement, Terre, Eau Laboratoire de recherche : DIADE - Diversité, Adaptation et DEveloppement des plantes Direction de la thèse : Romain GUYOT ORCID 0000000270167485 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-05-07T23:59:59 Les éléments transposables (ETs) sont des séquences d'ADN mobiles qui jouent un rôle fondamental dans l'évolution et la plasticité des génomes. Ils contribuent à la régulation de l'expression des gènes, à l'adaptation des espèces à leur environnement et à la divergnece des génomes, pouvant conduire à la spéciation. Le genre Coea regroupe 141 espèces, présentant une grande diversité phénotypique et un fort potentiel pour l'amélioration des caféiers cultivés, notamment en matière de résistance aux mala-dies et d'adaptation aux variations climatiques. Toutefois, leur diversité et leur dynamique évolutive reste encore peu explorée, notamment en ce qui concerne rôle dans l'adaptation aux environnements contrastés et à la spéciation des espèces. Ce projet de thèse s'intéresse à la diversité et à l'impact des ETs sur la structure des chromosomes, la variation de taille des génomes et l'adaptation des espèces du genre Coea. Dans ce cadre, il vise plus précisément à caractériser les ETs dans le genre Coea en exploitant les données génomiques générées dans le cadre du projet ANR internatio-nal Bridges\_Coea. Des approches de génomique comparative seront aussi déployées pour com-prendre leur rôle dans la divergence génomique et l'adaptation des espèces sur un pas de temps évolu-tif de 15 millions d'années. D'ici 2032, les températures mondiales devraient augmenter de 1,5 °C au rythme actuel, et une hausse de 2 °C pourrait être atteinte d'ici 2057. Ces changements climatiques auront des conséquences ma-jeures sur l'environnement, réduisant drastiquement les surfaces cultivables, augmentant les stress biotique
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