Thèse Expansion du Code Génétique pour la Bioimagerie de Super-Résolution des Facteurs de Virulence Bactériens H/F

Description

Détail du poste Établissement : Université de Lille École doctorale : Biologie Santé de Lille Laboratoire de recherche : UGSF - Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle Direction de la thèse : Cedric LION ORCID 0000000165914573 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-04-28T23:59:59 Les pili bactériens sont des appendices filamenteux de surface jouant un rôle central dans de nombreux processus biologiques, tels que l'adhésion des bactéries aux surfaces et aux cellules hôtes, la motilité, la formation de biofilms et le transfert horizontal de gènes. Parmi eux, les pili de type IV (T4P) constituent des facteurs de virulence majeurs chez de nombreuses bactéries pathogènes, dont Acinetobacter baumannii. Malgré leur importance biologique et médicale, l'étude de leur organisation, de leur dynamique et de leur fonctionnement in situ demeure limitée par le manque d'outils permettant leur visualisation spécifique, non perturbative et compatible avec des approches de bioimagerie avancée. En particulier, la barrière de résolution en microscopie optique classique impose une résolution insuffisante pour visualiser ces structures fines, rendant nécessaire le développement de méthodes de marquage compatibles avec l'imagerie en super-résolution. Ce projet interdisciplinaire s'inscrit à l'interface entre la microbiologie, la chimie, la biologie moléculaire et la bioimagerie, et vise à développer de nouvelles stratégies pour la visualisation et l'étude des facteurs de virulence bactériens par microscopie de super-résolution. L'objectif principal est d'exploiter l'expansion du code génétique et la chimie bioorthogonale afin d'incorporer de manière site-spécifique des acides aminés non canoniques (non-canonical amino acids, NCAA) au sein des protéines constituant les pili bactériens, en particulier les T4P. Ces NCAA porteront des fonctions chimiques réactives permettant un marquage sélectif via des réactions de chimie click rapides et compatibles avec