Les missions du poste L'Institut pour l'Avancée des Biosciences (IAB) est un institut de renommée internationale en recherche biomédicale fondamentale et translationnelle, basé à Grenoble/La Tronche. Il est une unité multi-tutelles Université Grenoble Alpes, Inserm (U1209) et CNRS (UMR 5309). Les recherches visent à comprendre les mécanismes moléculaires et cellulaires d'adaptation des systèmes biologiques à leur environnement, avec un focus sur l'épigénétique, l'environnement, la plasticité cellulaire et le cancer. L'IAB rassemble environ 19 équipes/ groupes de recherche, soutenus par plusieurs plateformes technologiques, au sein d'un environnement fortement collaboratif. Equipe : Dr Anna Reymer La personne recrutée aura pour mission de décrypter les mécanismes de régulation responsables de l'expression transcriptionnelle différentielle des isoformes de p53 (TP53) selon les tissus et les contextes physiopathologiques. Le projet vise à identifier et hiérarchiser les déterminants génétiques et épigénétiques (variants germinaux, régions régulatrices, promoteurs/épissage) associés aux profils d'expression des isoformes, en exploitant des données omiques à grande échelle (RNA-seq, génotypage/WGS, expression allèle-spécifique), notamment issues de cohortes publiques via des approches de bioinformatique et d'apprentissage automatique. Activités : · Collecter, curer et analyser des jeux de données transcriptomiques et génomiques (RNA-seq, génotypes/WGS, ASE) et quantifier l'expression des isoformes de p53 (ratios, déséquilibres haplotypiques). · Corréler les profils d'expression es variations génétiques (SNP, CNV, haplotypes) et annoter les variants par rapport aux éléments régulateurs (promoteurs, sites d'épissage, régions fonctionnelles). · Développer et évaluer des modèle (apprentissage supervisé, méthodes d'interprétabilité, modèles de séquence/réseaux) pour prédire et expliquer les déterminants des profils d'isoformes. · Valoriser les résultats : présentations en réun
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