Les missions du poste L'Institut de Cancérologie de l'Ouest (ICO) est un établissement de santé privé d'intérêt collectif qui assure des missions de prévention, de soin, de recherche et d'enseignement. Afin de développer son activité de recherche sur données de vie réelles, l'ICO développe son propre Entrepôt de Données de Santé (EDS). L'objectif est d'utiliser les différentes sources de données existantes à l'ICO dans le cadre de la recherche ou du soin afin de créer une unique base de données structurées contenant les variables considérées comme les plus importantes pour mener des travaux de recherche sur données observationnelles. Aujourd'hui l'EDS est alimenté à partir des bases de données structurées disponibles à l'ICO et des travaux sont en cours dans le but d'extraire des données structurées à partir des documents des patients (comptes rendus de consultation, comptes rendus d'anatomopathologie, etc.). Depuis quelques années, de nombreuses études ont montré qu'il est possible d'extraire des données structurées à partir des comptes rendus en utilisant le NLP (Natural Language Processing) mais toutes ces études reposent sur une méthode nécessitant une longue et coûteuse phase d'annotation afin d'entrainer le modèle (1-6). A l'ICO nous avons réalisé un premier travail montrant les capacités d'un algorithme basé sur le Large Language Model (LLM) Mistral Large à extraire les données de 3 biomarqueurs du cancer du sein à partir des comptes-rendus d'anatomopathologie. L'alternance consistera à poursuivre les développements de cet algorithme afin extraire d'autres données structurées à partir des comptes-rendus médicaux des patients. Poste rattaché au Service Data Factory & Analytics (Direction Développement et Innovation). L'objectif principal est de poursuivre le développement de l'algorithme permettant d'automatiser le processus d'extraction d'informations pertinentes à partir de documents médicaux non structurés et d'évaluer les performances de cette solution. Tâ
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