Détail du poste Établissement : Université Paris-Saclay GS Life Sciences and Health École doctorale : Structure et Dynamique des Systèmes Vivants Laboratoire de recherche : GABI - Génétique animale et Biologie intégrative Direction de la thèse : Elisabetta GIUFFRA ORCID 0000000195682056 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-07-31T23:59:59 Dans le contexte du changement climatique, il est essentiel de prévenir les infections pathogènes et d'anticiper les épidémies infectieuses, non seulement pour l'industrie porcine, mais aussi dans l'optique des programmes One Health et d'EcoHealth. La sélection tend à réduire la diversité génétique des populations. Une conséquence potentielle est la perte d'allèles ou variants génétiques clés des populations ce qui limite leur capacité à s'adapter aux pathogènes récurrents et émergents. On peut supposer que les programmes d'élevage permettant de maintenir la diversité génétique au niveau des loci clés de la réponse immunitaire de l'hôte pourraient offrir aux éleveurs de porcs un niveau de protection durable. D'autre part, la collecte des caractères de résistance à des maladies infectieuses in vivo est onéreuse et éthiquement discutable. Dans ce contexte des 3R du bien-être animal en recherche (remplacement, réduction, raffinement), le phénotypage in vitro offre une alternative. L'objectif de la thèse est d'établir un workflow in silico-in vitro permettant d'identifier la diversité génétique de loci sélectionnés et valider son caractère fonctionnel, dans des populations commerciales. Bien que motivé par l'objectif à long terme de fournir des données pour modéliser la préservation de leur diversité tout en maintenant les objectifs de production, ce sujet dépasse le cadre de la thèse. Pour sa réalisation, le projet s'appuie sur l'ensemble des connaissances disponibles sur les récepteurs viraux et les facteurs de restriction de l'hôte sur le SarsCov-2 humain et d'autres coronavirus, y compris les coronavirus
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